Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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