Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H3

Trbv16, T cell receptor beta, variable 16 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv16A0A0B4J1H3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trbv16A0A0B4J1H3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv16A0A0B4J1H3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv16A0A0B4J1H3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv16A0A0B4J1H3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv16A0A0B4J1H3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv16A0A0B4J1H3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv16A0A0B4J1H3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv16A0A0B4J1H3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv16A0A0B4J1H3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv16A0A0B4J1H3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv16A0A0B4J1H3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv16A0A0B4J1H3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv16A0A0B4J1H3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv16A0A0B4J1H3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv16A0A0B4J1H3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv16A0A0B4J1H3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv16A0A0B4J1H3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv16A0A0B4J1H3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv16A0A0B4J1H3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv16A0A0B4J1H3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv16A0A0B4J1H3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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