Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Npm1-203ENSMUST00000101375 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm12851-201ENSMUST00000117920 421 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm11416-201ENSMUST00000119111 863 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Mup-ps24-201ENSMUST00000119939 286 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Hmgn2-ps1-201ENSMUST00000120716 279 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm11739-201ENSMUST00000125269 723 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm12648-201ENSMUST00000126270 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Tctex1d2-201ENSMUST00000014220 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Paip1-206ENSMUST00000173627 1233 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm10182-201ENSMUST00000178676 273 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm28244-201ENSMUST00000189342 356 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm29175-201ENSMUST00000189500 402 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm2939-201ENSMUST00000198496 478 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm7695-201ENSMUST00000220900 641 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Olfr304-201ENSMUST00000077210 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Serpina1f-201ENSMUST00000021490 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 1110008L16Rik-202ENSMUST00000183475 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Vwa3b-206ENSMUST00000169057 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 C87977-202ENSMUST00000105754 1407 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Rnf4Q9QZS2 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Rnf4Q9QZS2 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Kbtbd8os-201ENSMUST00000135145 427 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Rnf4Q9QZS2 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Rnf4Q9QZS2 Mir5623-201ENSMUST00000176631 70 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Rnf4Q9QZS2 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Rnf4Q9QZS2 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 2900045O20Rik-201ENSMUST00000218374 1292 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm6993-201ENSMUST00000219110 210 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 AC207128.2-202ENSMUST00000224010 808 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Ssr3-201ENSMUST00000029414 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Rasgrf1-201ENSMUST00000034909 853 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Arhgef38-201ENSMUST00000054105 814 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Snora57-201ENSMUST00000093658 148 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Paip1-202ENSMUST00000109203 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm37980-201ENSMUST00000194420 1910 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Pla2g4c-ps-201ENSMUST00000204668 1364 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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