Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm44141-201ENSMUST00000204231 1583 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Igkv6-29-201ENSMUST00000103379 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm23358-201ENSMUST00000103887 110 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Wfdc2-202ENSMUST00000109344 429 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm15355-201ENSMUST00000118929 285 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Rpl9-ps2-201ENSMUST00000120821 577 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm11933-201ENSMUST00000121550 375 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Milr1-203ENSMUST00000147326 1234 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Mark1-ps3-201ENSMUST00000184922 694 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm28421-201ENSMUST00000186378 356 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm28355-201ENSMUST00000187443 356 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm37800-201ENSMUST00000192129 664 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm34217-201ENSMUST00000193562 356 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm45800-201ENSMUST00000210331 700 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm31497-201ENSMUST00000216981 638 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm21321-201ENSMUST00000220179 446 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 AL645704.1-201ENSMUST00000221642 604 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 AC107663.2-201ENSMUST00000225534 1234 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Churc1-201ENSMUST00000041262 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm4956-201ENSMUST00000082032 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Olfr225-202ENSMUST00000213169 2658 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Use1Q9CQ56 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Use1Q9CQ56 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Use1Q9CQ56 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Use1Q9CQ56 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Use1Q9CQ56 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Use1Q9CQ56 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
Use1Q9CQ56 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Use1Q9CQ56 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Use1Q9CQ56 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Use1Q9CQ56 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Use1Q9CQ56 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Use1Q9CQ56 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Use1Q9CQ56 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Use1Q9CQ56 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Use1Q9CQ56 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Use1Q9CQ56 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Use1Q9CQ56 Mir467f-201ENSMUST00000116923 120 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Use1Q9CQ56 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Use1Q9CQ56 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Use1Q9CQ56 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms