Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Cyp2c29-201ENSMUST00000003137 1783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Vmn1r199-202ENSMUST00000227685 5713 ntAPPRIS P2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Pkd1-201ENSMUST00000035565 14164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Ablim1-207ENSMUST00000111529 5927 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Fbxw10-201ENSMUST00000036085 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Pdgfd-201ENSMUST00000058692 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Itpr1-201ENSMUST00000032192 9870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Traf3-202ENSMUST00000060274 6896 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Cpsf2-201ENSMUST00000047357 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Tiam1-213ENSMUST00000163370 7255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Glod4-206ENSMUST00000169701 4203 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Fam160a1-202ENSMUST00000118408 4445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Tmc2-202ENSMUST00000166774 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Ick-202ENSMUST00000044551 6560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Lsamp-202ENSMUST00000099761 8794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Ubr5-204ENSMUST00000226414 8397 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Veph1-201ENSMUST00000029419 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Spag11b-202ENSMUST00000110767 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Olfr1432-202ENSMUST00000207710 2068 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Flna-203ENSMUST00000114299 8456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Sept3-201ENSMUST00000023095 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Olfr943-202ENSMUST00000213176 8275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gucy2c-202ENSMUST00000078095 3863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Nemp1-201ENSMUST00000048099 6002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Cers4-201ENSMUST00000008350 9475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm26967-201ENSMUST00000182878 2303 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 AC107453.1-201ENSMUST00000227490 3268 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Pnp-203ENSMUST00000048615 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Fbln5-201ENSMUST00000021603 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.7 ms