Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 6530403H02Rik-201ENSMUST00000182099 402 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7734-201ENSMUST00000182832 1011 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21013-201ENSMUST00000184952 1201 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29416-202ENSMUST00000191328 1201 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29462-201ENSMUST00000191458 288 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 4933403L11Rik-201ENSMUST00000193857 1121 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26911-203ENSMUST00000204781 369 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Ceacam-ps1-201ENSMUST00000205380 794 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr696-ps1-201ENSMUST00000207160 948 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5535-206ENSMUST00000210067 679 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45795-201ENSMUST00000211847 400 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm39456-201ENSMUST00000214759 1019 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21321-201ENSMUST00000220179 446 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10283-201ENSMUST00000093494 354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Wac-202ENSMUST00000092112 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Wfdc2-202ENSMUST00000109344 429 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12604-201ENSMUST00000118382 380 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11416-201ENSMUST00000119111 863 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Obox2-203ENSMUST00000174076 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29000-202ENSMUST00000185562 571 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29617-203ENSMUST00000186558 1033 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6799-201ENSMUST00000186919 573 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28677-203ENSMUST00000187144 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28749-204ENSMUST00000187827 571 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 9330159M07Rik-204ENSMUST00000188156 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29178-207ENSMUST00000188496 1013 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28844-206ENSMUST00000189297 815 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37247-201ENSMUST00000192549 730 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm30275-201ENSMUST00000197620 498 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5857-201ENSMUST00000198953 493 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35412-201ENSMUST00000220437 999 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 AC163660.3-202ENSMUST00000224917 464 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr139-201ENSMUST00000050678 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms