Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 BC049715-203ENSMUST00000203499 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Tex21-201ENSMUST00000021453 2137 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Adam18-201ENSMUST00000033957 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Zfp472-201ENSMUST00000039132 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Igsf1-203ENSMUST00000114891 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gpr35-201ENSMUST00000027489 3270 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm6313-202ENSMUST00000150112 2562 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Cnot2-204ENSMUST00000164088 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 n-R5s1-201ENSMUST00000101925 119 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gstm7-203ENSMUST00000106688 783 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Tsc22d1-205ENSMUST00000133224 786 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Rps16-ps2-201ENSMUST00000140155 441 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Lsm5-205ENSMUST00000203958 416 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Thy1-204ENSMUST00000214627 446 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm6885-201ENSMUST00000217261 372 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Defa37-201ENSMUST00000084040 403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Tnfaip6-201ENSMUST00000065927 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Olfr467-202ENSMUST00000208563 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Olfr467-203ENSMUST00000214253 1855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 4921521D15Rik-201ENSMUST00000197578 1927 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Il10ra-201ENSMUST00000034594 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gmeb1-207ENSMUST00000168553 6523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Naalad2-201ENSMUST00000001826 2831 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm5761-201ENSMUST00000119238 834 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm12126-201ENSMUST00000147717 619 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Ighv13-2-202ENSMUST00000183954 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm43560-201ENSMUST00000198100 773 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 A330076H08Rik-203ENSMUST00000208822 1164 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms