Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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NischQ80TM9 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm28968-201ENSMUST00000190413 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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NischQ80TM9 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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NischQ80TM9 Gm38121-201ENSMUST00000193213 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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NischQ80TM9 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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NischQ80TM9 Gm22748-201ENSMUST00000082493 136 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Tpd52l2-204ENSMUST00000108800 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Epn2-212ENSMUST00000178202 4317 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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NischQ80TM9 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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NischQ80TM9 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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NischQ80TM9 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Kcnip4-204ENSMUST00000166924 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm26903-201ENSMUST00000180749 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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NischQ80TM9 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Chrna1-201ENSMUST00000028515 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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NischQ80TM9 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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NischQ80TM9 Helz2-201ENSMUST00000094203 9162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Cfap65-201ENSMUST00000094844 5727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Aebp1-201ENSMUST00000102923 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 E330035G20Rik-201ENSMUST00000221094 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Cd101-202ENSMUST00000167086 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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NischQ80TM9 Sidt1-204ENSMUST00000127567 2901 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Cyp4v3-201ENSMUST00000095328 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Mcf2-202ENSMUST00000063507 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Npy2r-203ENSMUST00000182181 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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NischQ80TM9 Cul2-201ENSMUST00000025073 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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NischQ80TM9 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Abcc9-206ENSMUST00000205202 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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NischQ80TM9 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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NischQ80TM9 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Cdh13-201ENSMUST00000117160 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Casp14-202ENSMUST00000219237 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Unc5c-201ENSMUST00000075282 3890 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Supt7l-204ENSMUST00000201769 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Wfdc5-201ENSMUST00000045127 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NischQ80TM9 Htr2c-201ENSMUST00000036303 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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