Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Dpp6-203ENSMUST00000120555 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 1500026H17Rik-201ENSMUST00000181598 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 AC159379.2-201ENSMUST00000220244 2482 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Unc13d-201ENSMUST00000075036 3967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Ap2b1-205ENSMUST00000176430 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Hrh1-203ENSMUST00000160780 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Synrg-202ENSMUST00000092834 7115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Klf12-205ENSMUST00000228216 5890 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 P2ry4-201ENSMUST00000053373 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 2310015D24Rik-202ENSMUST00000187920 2917 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Pcdh15-225ENSMUST00000149977 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 B930018H19Rik-201ENSMUST00000211381 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Ttc41-203ENSMUST00000217747 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf19-202ENSMUST00000111236 3958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Stat1-206ENSMUST00000186857 4241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms