Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Fcer2a-207ENSMUST00000208492 1053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 AC120386.1-201ENSMUST00000213434 736 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm10577-201ENSMUST00000097954 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Tnfaip1-202ENSMUST00000108277 3768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm43686-201ENSMUST00000197351 2439 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Supt20-211ENSMUST00000200441 2154 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Il1rap-203ENSMUST00000166294 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Flii-201ENSMUST00000002889 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Apol10b-201ENSMUST00000089465 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Kdm4a-203ENSMUST00000106403 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm28042-202ENSMUST00000129685 4472 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Galk2-201ENSMUST00000028636 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm12108-201ENSMUST00000145338 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Hsp90ab1-201ENSMUST00000024739 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm42966-201ENSMUST00000197883 1691 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Me1-202ENSMUST00000185374 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm37409-201ENSMUST00000195811 1626 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Cntrl-202ENSMUST00000028237 7615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm12904-201ENSMUST00000117451 1399 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Kcnk2-209ENSMUST00000194402 1373 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Pex12-201ENSMUST00000018877 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Pzp-201ENSMUST00000112132 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm21026-201ENSMUST00000218628 1345 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Esd-201ENSMUST00000022573 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Ighv1-22-201ENSMUST00000103507 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm11223-201ENSMUST00000120560 450 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Ccpg1os-201ENSMUST00000124565 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 1700030A11Rik-201ENSMUST00000125317 888 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Tpsab1-202ENSMUST00000153118 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm25196-201ENSMUST00000180171 110 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Il24-202ENSMUST00000187650 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm3142-201ENSMUST00000190107 414 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm42529-201ENSMUST00000201843 741 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm45164-201ENSMUST00000207438 896 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm45014-201ENSMUST00000207657 405 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm33053-201ENSMUST00000215275 1144 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 AC153562.1-201ENSMUST00000215390 394 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 AC144461.2-201ENSMUST00000218219 303 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Tcstv3-202ENSMUST00000223967 779 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 AC158519.1-201ENSMUST00000228615 179 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Adamts4-202ENSMUST00000111315 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 3632451O06Rik-202ENSMUST00000118129 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Cul2-201ENSMUST00000025073 3727 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Plec-208ENSMUST00000080857 14959 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Ypel5-201ENSMUST00000045174 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm38348-201ENSMUST00000191718 2273 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Lypd6b-201ENSMUST00000028103 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Kprp-201ENSMUST00000072363 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Cnot2-209ENSMUST00000167706 1621 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Ddx1-201ENSMUST00000071103 4842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 4921509C19Rik-201ENSMUST00000080132 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms