Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Cep170-212ENSMUST00000194727 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Ogfod1-201ENSMUST00000060632 5214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm16427-203ENSMUST00000201432 2042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Prickle2-204ENSMUST00000113447 7679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Pcdh15-228ENSMUST00000152819 2867 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Kcnma1-224ENSMUST00000224077 3537 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm45477-201ENSMUST00000200213 5498 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Svil-210ENSMUST00000140448 7423 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Cacna1e-201ENSMUST00000004214 12697 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Frrs1-202ENSMUST00000195905 6823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Rdh16-201ENSMUST00000071646 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Sdr42e1-201ENSMUST00000037955 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Grhl1-201ENSMUST00000020985 3070 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Ankfn1-203ENSMUST00000169201 2232 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Cdkal1-201ENSMUST00000006353 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm884-202ENSMUST00000167262 4576 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 AC123842.1-201ENSMUST00000217622 3118 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Pygl-202ENSMUST00000161083 2992 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 4932415M13Rik-202ENSMUST00000184645 3063 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Rnf19a-203ENSMUST00000228358 3452 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Ints4-201ENSMUST00000026126 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Epg5-201ENSMUST00000044622 9672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Pgbd1-205ENSMUST00000151743 2642 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm35172-201ENSMUST00000196037 2649 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm43686-201ENSMUST00000197351 2439 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Mybbp1a-201ENSMUST00000045633 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Oas1e-203ENSMUST00000201172 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Ccdc141-202ENSMUST00000049544 8969 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Etv5-203ENSMUST00000168774 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Calhm2-202ENSMUST00000140512 3377 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Eya3-203ENSMUST00000081726 5160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Ace2-201ENSMUST00000073973 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm42692-201ENSMUST00000199482 2833 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Mmp27-201ENSMUST00000120900 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Olfr686-202ENSMUST00000214147 2646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Olfr686-203ENSMUST00000216143 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Olfr686-204ENSMUST00000216613 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Olfr1509-206ENSMUST00000215030 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms