Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Trav9n-3-201ENSMUST00000177705 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Trav9d-3-201ENSMUST00000178252 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Mir6415-201ENSMUST00000184064 100 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37247-201ENSMUST00000192549 730 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl22-201ENSMUST00000020820 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18192-201ENSMUST00000210174 941 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 AC158799.1-201ENSMUST00000214686 617 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18378-201ENSMUST00000216245 628 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 4933409F18Rik-201ENSMUST00000221910 1267 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Nasp-203ENSMUST00000081182 1461 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 St7-206ENSMUST00000115417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Kbtbd8-201ENSMUST00000032107 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 A430110L20Rik-202ENSMUST00000181680 2513 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10804-202ENSMUST00000162565 867 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 1700071M16Rik-202ENSMUST00000167672 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps33-204ENSMUST00000201461 717 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gpihbp1-201ENSMUST00000023243 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Trim40-203ENSMUST00000172711 1539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms