Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
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Ttc39dQ0VF76 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ttc39dQ0VF76 Lair1-204ENSMUST00000108600 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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Ttc39dQ0VF76 Rpl29-ps1-201ENSMUST00000161849 508 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ttc39dQ0VF76 Gm24576-201ENSMUST00000175508 248 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
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Ttc39dQ0VF76 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
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Ttc39dQ0VF76 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ttc39dQ0VF76 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ttc39dQ0VF76 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ttc39dQ0VF76 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ttc39dQ0VF76 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms