Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Sycp1-201ENSMUST00000029448 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Ppp2r3a-202ENSMUST00000075941 6786 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Mrpl19-201ENSMUST00000032124 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Ceacam20-201ENSMUST00000094753 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Znfx1-202ENSMUST00000067584 4147 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Adgrf2-201ENSMUST00000113614 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Ttc28-201ENSMUST00000040111 10780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Nsun6-204ENSMUST00000114715 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Mmp27-201ENSMUST00000120900 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm36993-201ENSMUST00000192983 2980 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Isy1-201ENSMUST00000089497 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 A630001O12Rik-201ENSMUST00000212914 2182 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Adgrb3-207ENSMUST00000151309 5448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Hipk2-207ENSMUST00000162359 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 AC158622.2-201ENSMUST00000217363 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Opcml-202ENSMUST00000115243 6676 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Ccdc47-201ENSMUST00000002043 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Plekha2-201ENSMUST00000064883 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Fam102b-201ENSMUST00000046924 5368 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Abca17-201ENSMUST00000039324 5202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Olfr1426-206ENSMUST00000219996 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Mapk14-203ENSMUST00000114752 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 BC048644-201ENSMUST00000140928 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Add1-205ENSMUST00000114340 3761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Prdm16-204ENSMUST00000105636 8426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Ccdc127-203ENSMUST00000160021 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gprin2-203ENSMUST00000226613 10354 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms