Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Pcdh11x-201ENSMUST00000050239 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Sh2d2a-201ENSMUST00000029709 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Itpr1-201ENSMUST00000032192 9870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Olfr1532-ps1-202ENSMUST00000207492 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Slco5a1-207ENSMUST00000188454 8463 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Glod4-206ENSMUST00000169701 4203 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm43686-201ENSMUST00000197351 2439 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Hivep2-201ENSMUST00000015645 9763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Vmn1r199-202ENSMUST00000227685 5713 ntAPPRIS P2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Tmem35a-201ENSMUST00000037687 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm15114-201ENSMUST00000112788 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Ppp2r3a-202ENSMUST00000075941 6786 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Nup155-201ENSMUST00000163765 6402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Fam160a1-202ENSMUST00000118408 4445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gbp7-202ENSMUST00000171263 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Olfr443-ps1-202ENSMUST00000204422 1617 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Cfap44-202ENSMUST00000120049 6199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Ank1-213ENSMUST00000141784 6566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Myo5c-201ENSMUST00000036555 6727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Wdfy3-207ENSMUST00000212024 10539 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Vmn2r-ps26-201ENSMUST00000202039 2111 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Rbm12-201ENSMUST00000059647 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Pla2r1-201ENSMUST00000112525 7112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms