Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm4863-201ENSMUST00000196907 1381 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 AC132384.7-201ENSMUST00000220198 1391 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Olfr380-203ENSMUST00000127789 1536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Rps19-ps2-201ENSMUST00000100614 438 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm12124-201ENSMUST00000120504 679 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Fam229b-206ENSMUST00000136546 592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Rps19-ps1-201ENSMUST00000168472 438 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Tmem147os-201ENSMUST00000180820 1276 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm18970-201ENSMUST00000186040 938 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm17970-201ENSMUST00000192199 685 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm8407-201ENSMUST00000192719 427 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm42884-201ENSMUST00000200729 422 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm42959-201ENSMUST00000202184 212 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Olfr1357-203ENSMUST00000205085 1012 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm3774-201ENSMUST00000209773 435 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 4930401C15Rik-201ENSMUST00000218300 865 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 AC154249.1-201ENSMUST00000226296 320 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 CT009550.3-201ENSMUST00000228542 455 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Mfap5-201ENSMUST00000032210 946 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm8882-201ENSMUST00000080849 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Nf1-201ENSMUST00000071325 11917 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Glrx-204ENSMUST00000223120 1333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Ccdc141-202ENSMUST00000049544 8969 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Hook3-201ENSMUST00000037182 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Olfr374-202ENSMUST00000210435 8718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm28485-201ENSMUST00000185300 1500 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm28684-201ENSMUST00000185586 1500 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm28422-201ENSMUST00000186112 1500 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm29447-201ENSMUST00000186407 1500 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm29628-201ENSMUST00000187206 1500 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm28316-201ENSMUST00000187576 1500 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm29313-201ENSMUST00000187866 1500 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm28252-201ENSMUST00000188457 1500 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm28950-203ENSMUST00000188826 1500 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm29303-201ENSMUST00000189215 1500 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm28220-201ENSMUST00000189607 1500 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm29342-202ENSMUST00000189689 1500 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm29116-202ENSMUST00000189963 1500 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm29081-203ENSMUST00000190140 1500 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm28726-201ENSMUST00000190994 1500 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm29386-203ENSMUST00000191185 1500 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm33954-202ENSMUST00000195188 1500 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm14056-201ENSMUST00000117198 642 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm15989-201ENSMUST00000121895 498 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm12517-201ENSMUST00000122082 425 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm15928-201ENSMUST00000122455 280 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Myl2-201ENSMUST00000014080 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm12514-201ENSMUST00000142782 568 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm4246-201ENSMUST00000172822 216 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Dxo-208ENSMUST00000174092 738 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm9399-201ENSMUST00000175771 639 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm9149-201ENSMUST00000182724 1007 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Calm5-201ENSMUST00000183198 589 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm29416-202ENSMUST00000191328 1201 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
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