Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm12967-201ENSMUST00000122147 289 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Rps12-ps9-201ENSMUST00000139165 399 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Bud31-207ENSMUST00000162594 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 1700015G11Rik-201ENSMUST00000180038 397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm9149-201ENSMUST00000182724 1007 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm28126-201ENSMUST00000185286 356 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm28421-201ENSMUST00000186378 356 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm28212-201ENSMUST00000187114 356 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm28355-201ENSMUST00000187443 356 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm29568-201ENSMUST00000187884 356 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm29080-201ENSMUST00000188565 356 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm28944-201ENSMUST00000188946 356 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm28908-201ENSMUST00000189002 356 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm29078-201ENSMUST00000190611 356 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm37247-201ENSMUST00000192549 730 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm34217-201ENSMUST00000193562 356 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm37339-201ENSMUST00000194142 392 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm42431-201ENSMUST00000196880 323 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm44427-201ENSMUST00000204123 456 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm9354-201ENSMUST00000209075 468 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm6909-201ENSMUST00000209825 989 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm4804-203ENSMUST00000222542 577 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gpihbp1-201ENSMUST00000023243 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 4930415O20Rik-201ENSMUST00000023728 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Lyzl1-201ENSMUST00000025076 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Tmem216-201ENSMUST00000025569 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Zfp120-202ENSMUST00000094538 1245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Rpl27-ps3-201ENSMUST00000097682 475 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RxraP28700 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Kif24-202ENSMUST00000108055 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 C130093G08Rik-201ENSMUST00000202489 2226 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 AC132384.7-201ENSMUST00000220198 1391 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Ociad1-203ENSMUST00000166823 3354 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Igkv8-28-201ENSMUST00000103380 305 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Trav9-2-201ENSMUST00000103654 563 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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RxraP28700 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm5541-201ENSMUST00000193248 1113 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm37185-201ENSMUST00000193852 410 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 4933403L11Rik-201ENSMUST00000193857 1121 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm43699-201ENSMUST00000201312 818 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm4898-201ENSMUST00000218519 832 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm8882-201ENSMUST00000080849 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RxraP28700 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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