Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gata4-203ENSMUST00000121312 2407 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Cd59b-203ENSMUST00000111131 555 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Aph1b-202ENSMUST00000113730 682 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm23840-201ENSMUST00000116950 97 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm15709-201ENSMUST00000118354 213 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm12003-201ENSMUST00000118518 1105 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm15571-201ENSMUST00000119887 637 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Bnip1-206ENSMUST00000135824 629 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Lrrc8dos-201ENSMUST00000135958 586 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Kcnab3os-201ENSMUST00000136196 566 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Rasgef1b-207ENSMUST00000166484 1296 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Lgals1-ps2-201ENSMUST00000170221 519 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm25190-201ENSMUST00000176664 95 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm18821-201ENSMUST00000184135 709 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Ms4a3-202ENSMUST00000186023 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm43797-201ENSMUST00000198221 532 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm10451-202ENSMUST00000219367 855 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm34278-201ENSMUST00000220534 622 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC167013.6-201ENSMUST00000226587 1067 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Llcfc1-201ENSMUST00000031900 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Cenpx-202ENSMUST00000055424 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm10260-201ENSMUST00000074072 561 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Tmem241-203ENSMUST00000092075 595 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr1270-201ENSMUST00000099754 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Tsga10-208ENSMUST00000193669 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Fam114a1-201ENSMUST00000031080 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Duxbl1-203ENSMUST00000172667 2209 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 1110008L16Rik-202ENSMUST00000183475 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Nt5c1b-202ENSMUST00000118657 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Tro-205ENSMUST00000151403 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm43609-201ENSMUST00000199084 2712 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Slc7a2-202ENSMUST00000098816 3677 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Unc79-208ENSMUST00000179002 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Nod2-202ENSMUST00000109634 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr484-202ENSMUST00000214722 4676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Nfasc-202ENSMUST00000094569 9739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Nutm1-201ENSMUST00000043970 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 1700001L19Rik-201ENSMUST00000022007 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Chd8-201ENSMUST00000089752 8190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 5430403N17Rik-201ENSMUST00000210717 2553 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Nmnat1-202ENSMUST00000105693 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm1070-201ENSMUST00000114185 2874 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 E230020D15Rik-201ENSMUST00000208097 5899 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Muc4-201ENSMUST00000096106 11277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Trerf1-205ENSMUST00000190080 7045 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Zbtb34-201ENSMUST00000091037 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm14762-202ENSMUST00000122953 1430 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Tex28-201ENSMUST00000078060 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Nat10-201ENSMUST00000028608 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Ulk4-201ENSMUST00000051479 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gimd1-204ENSMUST00000212804 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Map4k4-209ENSMUST00000192509 3918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Cacna1c-204ENSMUST00000112793 6669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Tmem164-203ENSMUST00000112888 4221 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm40841-202ENSMUST00000222823 3989 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Ttll4-201ENSMUST00000042125 10019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Cecr2-201ENSMUST00000100993 4849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 D7Bwg0826e-201ENSMUST00000208484 3795 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC132467.1-201ENSMUST00000226498 1845 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr621-ps1-201ENSMUST00000119741 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm12206-201ENSMUST00000119795 601 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm11763-201ENSMUST00000119964 312 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Iqcc-202ENSMUST00000121442 491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 A930031H19Rik-202ENSMUST00000153810 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm7707-201ENSMUST00000165950 1156 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm20319-201ENSMUST00000172522 771 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Mir6930-201ENSMUST00000183859 68 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm38306-201ENSMUST00000193954 237 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm44306-201ENSMUST00000203058 203 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm44285-201ENSMUST00000203557 940 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
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