Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 I830127L07Rik-202ENSMUST00000190944 405 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Gm43479-201ENSMUST00000200801 529 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Gm5307-201ENSMUST00000204772 760 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Gm45454-201ENSMUST00000211484 455 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Fgf21-201ENSMUST00000033099 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Olfr1449-201ENSMUST00000056005 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Alcam-207ENSMUST00000170035 1917 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P18530 Havcr1-202ENSMUST00000081819 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Uba1y-ps2-201ENSMUST00000190871 2544 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Lair1-204ENSMUST00000108600 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Mrps18c-202ENSMUST00000112898 460 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Gm14645-201ENSMUST00000118597 417 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Gm14000-201ENSMUST00000118670 233 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Vmn1r-ps103-201ENSMUST00000120171 893 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Snhg12-203ENSMUST00000128131 614 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Gm4891-201ENSMUST00000182279 912 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Mir1897-202ENSMUST00000198006 79 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Gm31881-202ENSMUST00000199455 559 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Gm44508-201ENSMUST00000206943 1157 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Gm34263-201ENSMUST00000214010 352 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Gm6150-202ENSMUST00000219888 2977 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 AC164978.1-201ENSMUST00000228608 4011 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Cyp2c55-201ENSMUST00000025966 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P18530 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
P18530 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms