Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Srgap2-201ENSMUST00000097588 8026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Acsl6-204ENSMUST00000093106 5804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Nek11-201ENSMUST00000038648 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Lrguk-201ENSMUST00000070189 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Tifab-202ENSMUST00000225063 2718 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Tacc2-202ENSMUST00000059145 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 4931406P16Rik-210ENSMUST00000206399 4158 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Foxp3-203ENSMUST00000115739 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 AW822252-205ENSMUST00000192662 1352 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Enox2-203ENSMUST00000114912 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 A930002I21Rik-201ENSMUST00000060946 1512 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Trav9-2-201ENSMUST00000103654 563 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Vwde-202ENSMUST00000203074 5626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Ints4-201ENSMUST00000026126 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm29128-201ENSMUST00000186448 2858 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm37314-201ENSMUST00000193545 2685 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Adgrl2-203ENSMUST00000168352 2151 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Olfr523-203ENSMUST00000213953 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Piwil4-203ENSMUST00000115644 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm16050-201ENSMUST00000160626 2363 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm7839-201ENSMUST00000210755 673 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Mkl2-201ENSMUST00000009713 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 D830032E09Rik-203ENSMUST00000189845 2092 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Fignl1-201ENSMUST00000047689 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Kcnk10-202ENSMUST00000221240 7460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Edar-201ENSMUST00000003312 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Dync1i2-207ENSMUST00000112142 2585 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm45769-201ENSMUST00000204588 1828 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Tcf4-206ENSMUST00000114982 3694 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm38249-201ENSMUST00000192560 2321 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 AC130219.1-201ENSMUST00000228406 3433 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm42895-201ENSMUST00000200761 2996 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm42777-201ENSMUST00000196026 3603 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm26896-201ENSMUST00000180482 2526 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Rpl37rt-202ENSMUST00000124641 294 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gsk3b-202ENSMUST00000114750 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Acvr1-202ENSMUST00000090935 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Zbtb18-201ENSMUST00000077225 4944 ntAPPRIS P3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Nkrf-201ENSMUST00000057093 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms