Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm25265-201ENSMUST00000158520 347 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm29240-201ENSMUST00000187248 286 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm38143-201ENSMUST00000191751 644 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Cd24a-202ENSMUST00000214476 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 AC137117.3-201ENSMUST00000226265 485 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Tmem225-201ENSMUST00000046333 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 3110009E18Rik-202ENSMUST00000056038 401 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 A230001M10Rik-203ENSMUST00000198712 1747 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Klf6-201ENSMUST00000000080 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm35208-201ENSMUST00000221590 1411 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Cyp2c53-ps-202ENSMUST00000175960 1370 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm8836-201ENSMUST00000198196 1348 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm25608-201ENSMUST00000104021 132 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Dtx3-205ENSMUST00000137151 346 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm25721-201ENSMUST00000157496 171 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Insig2-208ENSMUST00000160968 1204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm17122-201ENSMUST00000166047 372 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Olfr457-201ENSMUST00000170504 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm4246-201ENSMUST00000172822 216 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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H2-Eb1P04230 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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H2-Eb1P04230 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Hsd17b3-204ENSMUST00000222783 1184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Olfr1179-201ENSMUST00000099825 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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