Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Phf11a-201ENSMUST00000062307 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm42603-201ENSMUST00000199893 2146 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm32486-201ENSMUST00000209810 3816 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm4451-201ENSMUST00000186000 1891 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm36950-201ENSMUST00000191738 1499 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm23706-201ENSMUST00000104369 82 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm13683-201ENSMUST00000119497 1076 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Crem-218ENSMUST00000139537 807 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Mir1968-201ENSMUST00000157429 68 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm23094-201ENSMUST00000157551 322 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm25372-201ENSMUST00000158161 255 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Ifrd1-204ENSMUST00000165027 1293 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Mir6999-201ENSMUST00000183498 61 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm17867-201ENSMUST00000188981 391 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm37371-201ENSMUST00000194837 392 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm40304-201ENSMUST00000202154 268 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Rarres2-204ENSMUST00000204267 795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Rarres2-205ENSMUST00000204930 681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm44508-201ENSMUST00000206943 1157 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Olfr698-201ENSMUST00000074981 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Olfr285-201ENSMUST00000079736 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Olfr155-201ENSMUST00000095108 1172 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm31614-201ENSMUST00000215504 3231 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Tex52-202ENSMUST00000130785 1424 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm16409-201ENSMUST00000100510 747 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm12838-201ENSMUST00000116278 325 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn34c3J3QJW5 Rps6-ps4-201ENSMUST00000118499 750 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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