Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Lrba-206ENSMUST00000195524 3322 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Kantr-207ENSMUST00000195280 4212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Abr-204ENSMUST00000108407 4811 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Rtel1-203ENSMUST00000098971 4307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Hmgxb4-201ENSMUST00000041759 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Setd5-202ENSMUST00000113155 6362 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Kidins220-210ENSMUST00000222941 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Lhx4-201ENSMUST00000027740 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Rad21-201ENSMUST00000022927 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Csf3r-201ENSMUST00000030673 3160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm16536-201ENSMUST00000162209 1589 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Dusp3-202ENSMUST00000107172 4445 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Pnp-203ENSMUST00000048615 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Stox2-202ENSMUST00000110367 3424 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Zfp229-201ENSMUST00000065871 4525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Cobl-210ENSMUST00000174874 5451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Ctnnd1-219ENSMUST00000111693 6255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Vmn1r26-203ENSMUST00000228070 4419 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Tmem43-201ENSMUST00000032183 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Sbno1-216ENSMUST00000199808 10161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm45767-201ENSMUST00000212778 4561 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Pla2g2a-203ENSMUST00000135748 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm15507-203ENSMUST00000140958 658 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm16110-201ENSMUST00000161473 892 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 B3gnt2-201ENSMUST00000055549 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Nup155Q99P88 Olfr981-202ENSMUST00000215956 8197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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