Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Gm43158-201ENSMUST00000198484 1555 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm13915-201ENSMUST00000119314 931 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm20396-201ENSMUST00000173358 745 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm37481-201ENSMUST00000195176 403 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm43287-201ENSMUST00000197747 600 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm42760-201ENSMUST00000199814 311 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm19254-201ENSMUST00000204828 294 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm5535-206ENSMUST00000210067 679 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 CT009733.1-202ENSMUST00000224941 441 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Ndufa7-201ENSMUST00000048249 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Aoah-201ENSMUST00000021757 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Rtp4-201ENSMUST00000038423 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gsdmc4-202ENSMUST00000188108 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Olfr1346-202ENSMUST00000207658 4429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Zfp474-202ENSMUST00000209270 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Psma8-201ENSMUST00000040860 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Strbp-202ENSMUST00000072186 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Tcf4-206ENSMUST00000114982 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm15192-201ENSMUST00000121005 293 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm5835-201ENSMUST00000185806 1270 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 2610016A17Rik-203ENSMUST00000188711 515 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm31881-202ENSMUST00000199455 559 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Olfr572-202ENSMUST00000214096 1126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Olfr890-201ENSMUST00000079804 945 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Tcp10a-201ENSMUST00000095726 2442 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms