Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Mtbp-204ENSMUST00000169667 2570 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Zfp445-201ENSMUST00000056467 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Wdr48-205ENSMUST00000215307 3776 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Dock1-201ENSMUST00000084488 6807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Ttc21b-201ENSMUST00000102718 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Elp3-201ENSMUST00000022609 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Ighj1-201ENSMUST00000103430 53 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm12142-201ENSMUST00000117114 485 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm7803-201ENSMUST00000117176 1015 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Tmsb10-204ENSMUST00000144337 433 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm3239-202ENSMUST00000169675 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm6410-201ENSMUST00000181337 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Ppp1r2-ps7-202ENSMUST00000185057 763 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 1700049E22Rik-201ENSMUST00000187986 507 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm553-201ENSMUST00000189527 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 2610034O05Rik-201ENSMUST00000194078 855 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm44018-201ENSMUST00000204471 407 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm44902-201ENSMUST00000206177 805 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm45674-201ENSMUST00000210043 450 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Olfr471-201ENSMUST00000210091 936 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm18243-201ENSMUST00000220756 887 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms