Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm44546-201ENSMUST00000208353 368 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Tmem43-201ENSMUST00000032183 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Ttf2-201ENSMUST00000076941 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Rbbp4-201ENSMUST00000102598 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Uba7-201ENSMUST00000035216 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Sf3b3-201ENSMUST00000042012 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Tbc1d24-216ENSMUST00000202925 4216 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm10419-204ENSMUST00000198585 4059 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Arhgef40Q3UPH7 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Arhgef40Q3UPH7 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Arhgef40Q3UPH7 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Arhgef40Q3UPH7 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Grb10-203ENSMUST00000109654 4755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Arhgef40Q3UPH7 Hmgxb4-201ENSMUST00000041759 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Arhgef40Q3UPH7 Zfp551-201ENSMUST00000080348 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gys2-201ENSMUST00000032371 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Ambra1-201ENSMUST00000045699 4690 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gabrq-202ENSMUST00000114553 4943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gpm6b-203ENSMUST00000112224 4644 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Arhgef40Q3UPH7 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Arhgef40Q3UPH7 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Col28a1-201ENSMUST00000115537 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm8798-202ENSMUST00000213048 2357 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Ces1g-201ENSMUST00000044602 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm44531-201ENSMUST00000208364 2000 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Clip4-201ENSMUST00000024854 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Sox2ot-215ENSMUST00000199171 3486 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef40Q3UPH7 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.9 ms