Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 2310015D24Rik-202ENSMUST00000187920 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 AC158596.1-201ENSMUST00000217315 2265 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Mtrf1-201ENSMUST00000022600 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Wee2-201ENSMUST00000038907 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 1700074P13Rik-201ENSMUST00000031935 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Pik3r4-201ENSMUST00000065778 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Adgrg7-201ENSMUST00000023437 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Patj-206ENSMUST00000107033 3624 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Ankrd6-203ENSMUST00000084749 4573 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Arhgap17-204ENSMUST00000205262 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Myof-201ENSMUST00000041475 6902 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm42700-201ENSMUST00000199071 2437 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Supt20-203ENSMUST00000197502 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Ganc-205ENSMUST00000135074 4780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Olfr859-203ENSMUST00000217280 9596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Tmem52b-201ENSMUST00000032263 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Paqr7-202ENSMUST00000095074 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Btbd18-201ENSMUST00000133437 3052 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm44423-201ENSMUST00000203746 3158 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Nedd4l-204ENSMUST00000224347 3150 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Vezt-203ENSMUST00000118205 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 5430420F09Rik-201ENSMUST00000194956 1799 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Fbxw10-201ENSMUST00000036085 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Olfr523-205ENSMUST00000215785 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Lmod1-201ENSMUST00000059352 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Clec1a-201ENSMUST00000037481 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 2010111I01Rik-202ENSMUST00000091560 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Ptprr-201ENSMUST00000063470 3619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Nutm1-201ENSMUST00000043970 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 I830127L07Rik-201ENSMUST00000187250 730 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Cryab-203ENSMUST00000214962 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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