Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Sept14-201ENSMUST00000042266 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Trav12-1-201ENSMUST00000103650 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm11838-201ENSMUST00000121999 231 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 4930403D09Rik-201ENSMUST00000147359 635 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps52-201ENSMUST00000176211 612 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Mir6912-201ENSMUST00000184456 70 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm42431-201ENSMUST00000196880 323 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm16273-201ENSMUST00000202238 268 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm31579-201ENSMUST00000203306 966 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm45255-201ENSMUST00000209943 811 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm36849-201ENSMUST00000210345 680 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm8767-201ENSMUST00000215786 1070 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Prap1-201ENSMUST00000026540 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Slurp2-201ENSMUST00000057932 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps95-201ENSMUST00000222423 2316 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 1810018F18Rik-202ENSMUST00000189546 1447 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC8.52□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC8.52□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Tgs1-201ENSMUST00000052712 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Dlg2-203ENSMUST00000107193 4910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Magea5-201ENSMUST00000069556 1360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Fv1-201ENSMUST00000094481 1380 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Adam3-201ENSMUST00000033958 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm15574-201ENSMUST00000119937 405 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm11933-201ENSMUST00000121550 375 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm13269-201ENSMUST00000143458 655 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm13068-202ENSMUST00000146250 876 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm15938-201ENSMUST00000150079 635 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm22811-201ENSMUST00000157468 154 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
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Sh3bp1P55194 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm14214-201ENSMUST00000184654 678 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm42667-201ENSMUST00000196132 234 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
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Sh3bp1P55194 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
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Sh3bp1P55194 Gm10283-201ENSMUST00000093494 354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm17229-202ENSMUST00000166792 1753 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Fgg-201ENSMUST00000048486 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm37980-201ENSMUST00000194420 1910 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm16638-202ENSMUST00000208892 8508 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Rapgef6-210ENSMUST00000207429 5164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Tmem175-201ENSMUST00000063272 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Rgs9-203ENSMUST00000106704 3464 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Enpp4-202ENSMUST00000143137 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Tmem33-202ENSMUST00000160352 5322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms