Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm26040-201ENSMUST00000158147 161 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm8266-201ENSMUST00000179745 1192 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 1190005I06Rik-203ENSMUST00000180677 533 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Mir6974-201ENSMUST00000184381 83 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Scgb2b4-ps-201ENSMUST00000186705 340 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm29651-201ENSMUST00000189088 697 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 D330037F02Rik-202ENSMUST00000217400 1247 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm4739-201ENSMUST00000218296 633 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
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Hoxd9P28357 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 AC130829.2-201ENSMUST00000222931 127 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm10054-201ENSMUST00000223362 431 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 AC154747.2-201ENSMUST00000225109 780 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 AC166574.2-201ENSMUST00000226751 381 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 AC130547.1-201ENSMUST00000228079 1047 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Bdh2-201ENSMUST00000029817 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Hoxd9P28357 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Hoxd9P28357 Ralgps2-201ENSMUST00000027886 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Hoxd9P28357 Klrb1c-203ENSMUST00000174404 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Cnot2-202ENSMUST00000105265 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gfpt2-201ENSMUST00000020629 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Hoxd9P28357 Helz2-202ENSMUST00000108831 10109 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Hoxd9P28357 Gm28880-201ENSMUST00000190161 2160 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Olfr523-203ENSMUST00000213953 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Dusp3-206ENSMUST00000151678 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Celf5-204ENSMUST00000120856 3861 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Mcf2l-208ENSMUST00000110879 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm43413-201ENSMUST00000200411 1566 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm44883-201ENSMUST00000206063 3258 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm20531-201ENSMUST00000174861 1373 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Dgkh-206ENSMUST00000228362 3308 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Rbms3-202ENSMUST00000068962 3320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Zhx3-201ENSMUST00000103111 9563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 4930466I24Rik-201ENSMUST00000144105 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Tlr5-201ENSMUST00000110997 3199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Mcm10-201ENSMUST00000027980 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Rps20-203ENSMUST00000138502 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm26633-201ENSMUST00000180546 3256 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Pde10a-201ENSMUST00000024647 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Fam214a-201ENSMUST00000081746 3795 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Scn2a-205ENSMUST00000200829 6348 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
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