Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 AC154738.3-201ENSMUST00000227953 409 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 AC154528.3-201ENSMUST00000228011 679 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 AC166822.2-201ENSMUST00000228746 275 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Thyn1-201ENSMUST00000039161 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Olfr304-201ENSMUST00000077210 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Cst7-201ENSMUST00000089200 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Zfp809-205ENSMUST00000215618 1313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 1700011H14Rik-201ENSMUST00000022398 1349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm1976-202ENSMUST00000182639 1853 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Nrxn3-210ENSMUST00000167887 3303 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gabarap-202ENSMUST00000108592 750 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm15355-201ENSMUST00000118929 285 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm9516-201ENSMUST00000119684 424 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm16267-201ENSMUST00000140569 732 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 4921523L03Rik-201ENSMUST00000175729 1186 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Scgb2b30-201ENSMUST00000187013 336 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm17867-201ENSMUST00000188981 391 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm29041-201ENSMUST00000189199 380 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm6750-201ENSMUST00000189273 268 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 1700124L16Rik-203ENSMUST00000190077 1110 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Scgb2b10-201ENSMUST00000191403 318 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm37247-201ENSMUST00000192549 730 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm31243-201ENSMUST00000197498 632 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm7210-201ENSMUST00000209309 1067 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 AC130829.2-201ENSMUST00000222931 127 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 6330409D20Rik-201ENSMUST00000009695 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 AC125487.1-201ENSMUST00000217888 1300 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm26561-201ENSMUST00000180743 1413 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.5 ms