Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Adgrg1-201ENSMUST00000093271 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm44802-201ENSMUST00000208026 1916 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gtpbp8-204ENSMUST00000162512 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Xpnpep3-201ENSMUST00000041609 3236 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 A530021J07Rik-202ENSMUST00000207727 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Srbd1-201ENSMUST00000095187 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Hnf4g-201ENSMUST00000108393 2224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Cks1brt-202ENSMUST00000211617 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 B930018H19Rik-201ENSMUST00000211381 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Tmem43-201ENSMUST00000032183 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Serping1-201ENSMUST00000023994 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Lrrk2-201ENSMUST00000060642 8275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Crtam-201ENSMUST00000034519 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 AC163342.1-201ENSMUST00000216533 2718 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm42656-201ENSMUST00000201506 2305 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Luzp1-207ENSMUST00000170102 7526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Zfx-203ENSMUST00000113926 6762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Il1rl2-201ENSMUST00000095020 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Olfr1124-202ENSMUST00000215909 2422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Zfp758-204ENSMUST00000149699 2876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Prpf40a-208ENSMUST00000210789 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Pitpnm2os1-201ENSMUST00000161697 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Ednra-201ENSMUST00000034029 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Rhof-204ENSMUST00000186469 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Mfn2-201ENSMUST00000030884 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Osmr-204ENSMUST00000176826 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm16026-206ENSMUST00000163068 2741 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Sulf2-202ENSMUST00000109249 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Cdhr2-201ENSMUST00000037145 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Umodl1-201ENSMUST00000066554 5007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Stat6-201ENSMUST00000092074 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms