Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Patl2-201ENSMUST00000028665 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Cobl-210ENSMUST00000174874 5451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 A630012P03Rik-202ENSMUST00000114854 1974 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Olfr381-204ENSMUST00000215358 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Ctnnd1-203ENSMUST00000067232 6119 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Nlrp3-201ENSMUST00000079476 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Ccdc169-201ENSMUST00000052904 2889 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Plag1-201ENSMUST00000003369 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Tmem33-202ENSMUST00000160352 5322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Usp47Q8BY87 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Usp47Q8BY87 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Pak7-202ENSMUST00000077200 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Usp47Q8BY87 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Usp47Q8BY87 Celf5-204ENSMUST00000120856 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Fnbp1-201ENSMUST00000073879 8469 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Map1a-202ENSMUST00000110639 10145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Usp47Q8BY87 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Usp47Q8BY87 Cyld-203ENSMUST00000109626 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms