Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Spag11b-202ENSMUST00000110767 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Trav9-2-201ENSMUST00000103654 563 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Lhfpl2-202ENSMUST00000118195 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Hmgxb4-201ENSMUST00000041759 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm37549-201ENSMUST00000194096 4065 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Morc2b-201ENSMUST00000053896 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm44001-201ENSMUST00000203158 3773 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Tbc1d24-207ENSMUST00000171189 4592 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm44531-201ENSMUST00000208364 2000 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Ceacam20-201ENSMUST00000094753 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Tbc1d24-216ENSMUST00000202925 4216 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 9330102E08Rik-201ENSMUST00000204642 3843 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Creb1-202ENSMUST00000087366 8364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Unc5c-201ENSMUST00000075282 3890 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Fndc1-202ENSMUST00000097425 5845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Phf8-201ENSMUST00000046950 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm31152-201ENSMUST00000210319 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm10302-201ENSMUST00000174433 3535 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm37159-201ENSMUST00000192720 3605 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Aldh1l1-203ENSMUST00000130418 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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