Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 AC090654.1-201ENSMUST00000225584 1071 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 6642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Lrit1-201ENSMUST00000120052 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gpr85-203ENSMUST00000115492 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Smok3b-202ENSMUST00000166206 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Sox6-206ENSMUST00000205405 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Polr3k-201ENSMUST00000039551 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Ambra1-202ENSMUST00000045705 5203 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm13041-201ENSMUST00000122323 1524 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Lmntd1-202ENSMUST00000111708 1559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Supt7l-202ENSMUST00000200721 1657 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Igsf1-202ENSMUST00000072037 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Rpa1-202ENSMUST00000092907 5077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 AC163040.1-201ENSMUST00000222979 4288 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm15834-202ENSMUST00000139825 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Top3a-201ENSMUST00000002891 3741 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Hrh1-204ENSMUST00000161220 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm43532-201ENSMUST00000199389 3816 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Nlrp3-201ENSMUST00000079476 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Serpina3n-201ENSMUST00000021506 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Rgs9-204ENSMUST00000106706 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Scfd2-201ENSMUST00000072857 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm24433-201ENSMUST00000104080 133 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Olfr271-ps1-201ENSMUST00000121614 952 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm15942-201ENSMUST00000136305 810 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm12248-201ENSMUST00000137124 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm22396-201ENSMUST00000177110 53 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 n-R5s210-201ENSMUST00000177688 119 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Ighv6-4-201ENSMUST00000177949 297 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm11239-202ENSMUST00000179977 1080 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 D330041H03Rik-203ENSMUST00000180579 605 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Rian-211ENSMUST00000182737 699 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm37623-201ENSMUST00000193691 803 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Olfr271-ps1-202ENSMUST00000217546 852 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 AC102815.2-201ENSMUST00000227837 541 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm6028-201ENSMUST00000077111 574 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Olfr1393-201ENSMUST00000078932 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Trip4-203ENSMUST00000122410 3915 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm15826-201ENSMUST00000121328 1384 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 AC122937.3-201ENSMUST00000227906 1354 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm31898-201ENSMUST00000209232 1540 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Ncapg2-201ENSMUST00000084828 4684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm16575-201ENSMUST00000162186 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Thsd1-203ENSMUST00000162447 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm42575-201ENSMUST00000202942 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Tcam1-201ENSMUST00000044462 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Edar-201ENSMUST00000003312 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Dpysl3-202ENSMUST00000118043 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Mkl1-201ENSMUST00000109579 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm8204-201ENSMUST00000185696 2144 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 4930435N07Rik-201ENSMUST00000208065 2127 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm10696-201ENSMUST00000161475 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm10696-202ENSMUST00000167916 2205 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm12258-201ENSMUST00000093768 2524 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm17130-201ENSMUST00000201542 2683 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 AC123842.1-201ENSMUST00000217622 3118 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Uhrf1-201ENSMUST00000001258 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mkrn3Q60764 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms