Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm22669-201ENSMUST00000158723 318 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Ang-ps1-201ENSMUST00000162314 436 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Psd3-211ENSMUST00000178529 828 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Trav5d-4-201ENSMUST00000179701 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Trav5n-4-201ENSMUST00000179997 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm29362-201ENSMUST00000187898 133 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm37218-201ENSMUST00000192917 390 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm42628-201ENSMUST00000198498 764 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 AC114645.2-201ENSMUST00000214308 791 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 AC153937.3-201ENSMUST00000217814 706 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 AC025913.1-202ENSMUST00000220385 824 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Cenpx-202ENSMUST00000055424 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm5072-201ENSMUST00000063726 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Rpl21-ps3-201ENSMUST00000080223 483 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Rab25-201ENSMUST00000008745 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Sav1-201ENSMUST00000021467 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 0610031O16Rik-203ENSMUST00000185046 1429 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Calr4-203ENSMUST00000106629 1583 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Csnk1g1-209ENSMUST00000205379 4001 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Olfr329-ps-201ENSMUST00000108822 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Dnhd1-201ENSMUST00000106776 1146 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm14427-201ENSMUST00000117183 635 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm12038-201ENSMUST00000117322 207 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Mup-ps24-201ENSMUST00000119939 286 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm11300-201ENSMUST00000137651 565 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm24004-201ENSMUST00000158460 178 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Baat-202ENSMUST00000166036 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm22461-201ENSMUST00000175272 70 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Mir7060-201ENSMUST00000183486 137 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm27483-201ENSMUST00000184983 71 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 A430073D23Rik-201ENSMUST00000196262 665 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 AC157772.1-201ENSMUST00000226266 365 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Timm8b-201ENSMUST00000044051 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Fabp3-ps1-201ENSMUST00000070435 402 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 A630001G21Rik-201ENSMUST00000064788 1353 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 AC160138.2-201ENSMUST00000220255 1531 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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