Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC8□□□□□ -1.13
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Ttc39dQ0VF76 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 B230118H07Rik-203ENSMUST00000111231 2273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 Ankrd55-204ENSMUST00000168684 1005 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Ttc39dQ0VF76 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 Mir6919-201ENSMUST00000185146 62 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms