Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Unc5c-201ENSMUST00000075282 3890 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Serpinc1-201ENSMUST00000064725 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 C330007P06Rik-202ENSMUST00000115248 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Dlk1-206ENSMUST00000109846 4106 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Sntg1-207ENSMUST00000140295 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 D5Ertd615e-202ENSMUST00000197016 3911 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Tbc1d24-216ENSMUST00000202925 4216 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm17552-201ENSMUST00000181211 3877 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Pcyt1a-201ENSMUST00000079791 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Hipk2-207ENSMUST00000162359 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Olfr1426-206ENSMUST00000219996 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Sema6a-203ENSMUST00000115449 6815 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Sycp2l-201ENSMUST00000124093 2641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 2310057M21Rik-201ENSMUST00000059438 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Dpp6-203ENSMUST00000120555 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Ceacam20-201ENSMUST00000094753 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Sgsh-201ENSMUST00000005173 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Mtrf1-201ENSMUST00000022600 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Mrpl48-201ENSMUST00000064334 1865 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Acly-207ENSMUST00000165111 4162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 AC158622.2-201ENSMUST00000217363 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Ptpro-207ENSMUST00000203914 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Sox6-212ENSMUST00000206369 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Rab2b-202ENSMUST00000100631 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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