Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Gm22562-201ENSMUST00000157334 111 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Gm10804-202ENSMUST00000162565 867 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Gm16580-201ENSMUST00000162696 1044 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Ankrd55-204ENSMUST00000168684 1005 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Spp2-202ENSMUST00000176708 710 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Gm37481-201ENSMUST00000195176 403 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Gm45712-201ENSMUST00000212417 335 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Gm33684-201ENSMUST00000221119 263 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Olfr328-201ENSMUST00000073933 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Defa30-201ENSMUST00000098898 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Gm45464-201ENSMUST00000210728 2844 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Zmym1-201ENSMUST00000055013 3001 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Nasp-203ENSMUST00000081182 1461 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Myo1h-201ENSMUST00000124316 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 A230001M10Rik-203ENSMUST00000198712 1747 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
P18530 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 C130093G08Rik-201ENSMUST00000202489 2226 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Gm12695-201ENSMUST00000107071 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Gm8204-201ENSMUST00000185696 2144 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Cdk2ap1-203ENSMUST00000111473 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Gm23822-201ENSMUST00000158739 128 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 1700071M16Rik-202ENSMUST00000167672 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Apol11a-201ENSMUST00000172191 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Pid1-203ENSMUST00000175996 892 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Gm20627-202ENSMUST00000176275 564 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Gm38164-201ENSMUST00000192810 330 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Il15-203ENSMUST00000209573 1164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Gm18378-201ENSMUST00000216245 628 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 AC133189.3-201ENSMUST00000226269 878 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Ncoa7-210ENSMUST00000217138 2192 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
P18530 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms