Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37151-201ENSMUST00000194631 5007 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43792-201ENSMUST00000202492 2210 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Lrcol1-201ENSMUST00000100924 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15355-201ENSMUST00000118929 285 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Tpi-rs8-201ENSMUST00000120382 708 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp740-205ENSMUST00000121206 795 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr61-205ENSMUST00000130368 1162 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11632-201ENSMUST00000145489 674 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17197-201ENSMUST00000163160 452 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem147os-201ENSMUST00000180820 1276 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 1500004A13Rik-201ENSMUST00000183374 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6394-201ENSMUST00000197077 477 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2n-ps1-201ENSMUST00000201768 459 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 1700021F13Rik-202ENSMUST00000202665 469 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4536-201ENSMUST00000209157 542 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 2310003N18Rik-201ENSMUST00000215655 458 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35514-201ENSMUST00000221615 352 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 CT009550.3-201ENSMUST00000228542 455 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Rasgrf1-201ENSMUST00000034909 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr61-201ENSMUST00000051822 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Fam136b-ps-201ENSMUST00000068987 412 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cytl1-201ENSMUST00000073554 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1226-201ENSMUST00000099790 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29601-201ENSMUST00000187961 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Phf11a-201ENSMUST00000062307 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gmeb1-207ENSMUST00000168553 6523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Nhlrc3Q8CCH2 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms