Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Zfp661-204ENSMUST00000164551 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Magea2-203ENSMUST00000178950 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm26556-201ENSMUST00000180645 320 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 1700108F19Rik-204ENSMUST00000189375 494 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Mrpl55-201ENSMUST00000045697 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Hdac7-207ENSMUST00000120683 3701 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm16206-201ENSMUST00000132485 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Paics-202ENSMUST00000117536 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Cdh23-203ENSMUST00000105462 10592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm1627-201ENSMUST00000188504 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Fam171a1-202ENSMUST00000072955 3364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm11427-201ENSMUST00000117952 1696 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Rac2-201ENSMUST00000043214 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 C130093G08Rik-201ENSMUST00000202489 2226 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm15398-202ENSMUST00000219998 1477 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Itga10-201ENSMUST00000029744 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm16429-201ENSMUST00000179824 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Synj2-207ENSMUST00000115788 3498 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Arhgap36-201ENSMUST00000042444 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Zfp809-205ENSMUST00000215618 1313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 AC160405.2-201ENSMUST00000219008 1987 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm24482-201ENSMUST00000117005 93 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm12046-201ENSMUST00000118536 331 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Tmed5-206ENSMUST00000119784 689 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Wdr17-204ENSMUST00000129132 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Ndufa4-203ENSMUST00000204084 409 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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