Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Ptprb-203ENSMUST00000218553 7016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Deptor-202ENSMUST00000096433 8547 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Adam22-206ENSMUST00000115386 9056 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Mpdz-216ENSMUST00000220807 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Mx1-201ENSMUST00000023655 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm12459-201ENSMUST00000120659 356 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Usp47Q8BY87 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Mettl15-201ENSMUST00000081631 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm44950-201ENSMUST00000206403 2296 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 C130071C03Rik-201ENSMUST00000131907 3590 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Sorbs1-211ENSMUST00000224667 4313 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Usp47Q8BY87 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Usp47Q8BY87 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Usp47Q8BY87 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Cdh13-201ENSMUST00000117160 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Zfp942-202ENSMUST00000091879 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 AC154482.1-201ENSMUST00000223248 2483 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Vmn1r4-202ENSMUST00000176838 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 AC154355.1-201ENSMUST00000224604 2162 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Abcc12-201ENSMUST00000080115 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gas7-204ENSMUST00000108682 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Arpp21-202ENSMUST00000070218 3181 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp47Q8BY87 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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