Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Gm42775-201ENSMUST00000198407 740 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc29Q80VM3 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc29Q80VM3 D130017N08Rik-204ENSMUST00000199836 506 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc29Q80VM3 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc29Q80VM3 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc29Q80VM3 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc29Q80VM3 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc29Q80VM3 Nrxn3-210ENSMUST00000167887 3303 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc29Q80VM3 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc29Q80VM3 Ifit1-201ENSMUST00000102824 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc29Q80VM3 Gm6729-201ENSMUST00000165173 1452 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc29Q80VM3 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc29Q80VM3 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc29Q80VM3 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc29Q80VM3 Anxa9-201ENSMUST00000015846 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc29Q80VM3 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc29Q80VM3 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc29Q80VM3 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc29Q80VM3 Klhl5-205ENSMUST00000204348 3380 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ttc29Q80VM3 Gm17083-201ENSMUST00000165849 1366 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Ttc29Q80VM3 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ttc29Q80VM3 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ttc29Q80VM3 Cks1brt-201ENSMUST00000076896 2301 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ttc29Q80VM3 Cyp2c29-201ENSMUST00000003137 1783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ttc29Q80VM3 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ttc29Q80VM3 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ttc29Q80VM3 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ttc29Q80VM3 Ociad1-203ENSMUST00000166823 3354 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gucy2c-201ENSMUST00000032338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Acad11-201ENSMUST00000047799 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm11809-201ENSMUST00000120923 950 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm12967-201ENSMUST00000122147 289 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm17233-201ENSMUST00000168470 698 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Ttc29Q80VM3 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm42932-201ENSMUST00000197280 744 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Ttc29Q80VM3 AC154649.2-201ENSMUST00000228189 808 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Ttc29Q80VM3 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Ttc29Q80VM3 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Ttc29Q80VM3 Platr30-202ENSMUST00000199348 1934 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Srp54a-201ENSMUST00000021407 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Ttc29Q80VM3 Gm31152-201ENSMUST00000210319 2171 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Ttc29Q80VM3 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm7534-201ENSMUST00000097849 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 4932413F04Rik-201ENSMUST00000190332 2765 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 4931406P16Rik-210ENSMUST00000206399 4158 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Slmapos2-201ENSMUST00000160089 2194 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm13988-201ENSMUST00000119363 288 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Mgst1-207ENSMUST00000140932 742 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Olfr270-202ENSMUST00000172257 939 ntAPPRIS P2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms