Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm11760-201ENSMUST00000122355 796 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm24597-201ENSMUST00000122503 300 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 A530032D15Rik-203ENSMUST00000161724 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm17258-201ENSMUST00000168462 1266 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Pdzk1ip1-207ENSMUST00000171877 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Pdzk1ip1-208ENSMUST00000177647 826 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm8984-201ENSMUST00000183005 1019 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Mir6354-201ENSMUST00000184979 116 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm27483-201ENSMUST00000184983 71 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm28922-201ENSMUST00000189785 308 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Igkv3-6-201ENSMUST00000196007 342 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm6204-201ENSMUST00000198872 457 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm7384-201ENSMUST00000203682 530 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm28053-203ENSMUST00000204408 351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Olfr1279-201ENSMUST00000090329 942 ntAPPRIS P2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Npm1-202ENSMUST00000093201 1192 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Aadacl4-201ENSMUST00000094510 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Pex5l-208ENSMUST00000192093 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Mcf2l-204ENSMUST00000110867 3864 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Rsph14-203ENSMUST00000159994 1728 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 A530021J07Rik-205ENSMUST00000208699 1717 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Btbd11-202ENSMUST00000105306 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Chid1-201ENSMUST00000026586 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm43800-201ENSMUST00000201868 2731 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Ugt1a6a-202ENSMUST00000113134 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm44013-201ENSMUST00000204392 2262 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Clasp1-205ENSMUST00000185405 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm16214-201ENSMUST00000143710 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Pex2-205ENSMUST00000191916 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 H2-M10.5-201ENSMUST00000041531 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Cacng5-202ENSMUST00000106742 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Grhl3-201ENSMUST00000105855 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Smok4a-202ENSMUST00000144015 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm6480-201ENSMUST00000121552 1886 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm43376-201ENSMUST00000198939 1887 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Nbr1-206ENSMUST00000107213 4339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Alg8-201ENSMUST00000098300 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Ppp6c-201ENSMUST00000028087 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Pgk2-201ENSMUST00000033585 1592 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gpbp1-201ENSMUST00000047627 3694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Usp3-202ENSMUST00000098613 2797 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Vmn1r181-205ENSMUST00000228399 4616 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Lepr-201ENSMUST00000037552 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Htr2c-201ENSMUST00000036303 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Nckap5-202ENSMUST00000094609 2965 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Cd36-201ENSMUST00000082367 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Olfr156-204ENSMUST00000215406 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Ap5s1-204ENSMUST00000110210 1101 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Cdk2ap1-203ENSMUST00000111473 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm6880-201ENSMUST00000114125 627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gng12-207ENSMUST00000114228 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm12452-201ENSMUST00000117128 331 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm15363-201ENSMUST00000118897 631 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm12864-201ENSMUST00000122207 1006 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm13053-201ENSMUST00000128385 459 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Tcl1b2-202ENSMUST00000142230 851 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 1810021B22Rik-205ENSMUST00000162579 544 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Rpl6l-201ENSMUST00000171120 871 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 A330094K24Rik-201ENSMUST00000180530 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 D330041H03Rik-206ENSMUST00000181259 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Anks1b-209ENSMUST00000182083 416 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm20936-201ENSMUST00000191049 658 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mkrn3Q60764 AC137127.2-201ENSMUST00000215086 935 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms