Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

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Length 1,197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Gm18353-201ENSMUST00000185906 784 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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Zbtb38Q3LR78 Gm29068-201ENSMUST00000191607 400 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Gm43218-201ENSMUST00000196275 344 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Gm23604-202ENSMUST00000198428 137 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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Zbtb38Q3LR78 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Zbtb38Q3LR78 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 CT030646.1-201ENSMUST00000225049 980 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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Zbtb38Q3LR78 Apoa2-201ENSMUST00000005824 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Mill2-202ENSMUST00000072415 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Gm15401-201ENSMUST00000081929 1107 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Rpl27-ps3-201ENSMUST00000097682 475 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Pitpnm2os1-201ENSMUST00000161697 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Sgsh-202ENSMUST00000100172 4223 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Lrguk-201ENSMUST00000070189 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Rfx3-208ENSMUST00000174850 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 4930503E24Rik-201ENSMUST00000219167 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Gucy2d-203ENSMUST00000206435 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Gm37121-201ENSMUST00000192219 2556 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Pdgfrb-202ENSMUST00000115274 5423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Lipa-202ENSMUST00000178114 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Serpina3k-201ENSMUST00000043058 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 2010111I01Rik-202ENSMUST00000091560 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Trim42-201ENSMUST00000035026 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 H2-M10.5-201ENSMUST00000041531 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Gm42737-201ENSMUST00000201074 1755 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Olfr954-202ENSMUST00000214818 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
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Zbtb38Q3LR78 Smoc1-202ENSMUST00000110347 3496 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Zbtb38Q3LR78 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
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Zbtb38Q3LR78 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 Brdt-202ENSMUST00000112677 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 Gm12002-202ENSMUST00000153794 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 CT009757.2-201ENSMUST00000220806 2028 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
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Zbtb38Q3LR78 Gm28884-201ENSMUST00000190367 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 Ldb2-201ENSMUST00000070748 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Zbtb38Q3LR78 Mtmr4-202ENSMUST00000103179 5753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Zbtb38Q3LR78 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 1700034H15Rik-205ENSMUST00000154116 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Zbtb38Q3LR78 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 Gm29041-201ENSMUST00000189199 380 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 4930448I18Rik-201ENSMUST00000197958 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Zbtb38Q3LR78 Gm42745-201ENSMUST00000200904 193 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 Gm43069-201ENSMUST00000201006 859 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 Gm43806-201ENSMUST00000201766 469 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 Gm5609-201ENSMUST00000210008 1267 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 Tmem156-205ENSMUST00000212194 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 Gm32688-201ENSMUST00000213849 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 AC160635.1-201ENSMUST00000216731 474 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 Ubd-201ENSMUST00000038844 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 Olfr970-201ENSMUST00000071132 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 Olfr1333-201ENSMUST00000076019 954 ntAPPRIS P2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 Lcn11-201ENSMUST00000091278 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 AC079245.1-201ENSMUST00000215680 1454 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 Kng1-203ENSMUST00000089902 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbtb38Q3LR78 Vmn1r40-204ENSMUST00000228485 2689 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms