Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 CT009556.2-201ENSMUST00000227980 1123 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Gpihbp1-201ENSMUST00000023243 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Ttll4-201ENSMUST00000042125 10019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Iars-201ENSMUST00000047363 4396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Gm12608-201ENSMUST00000122013 1715 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Il5ra-201ENSMUST00000167925 1704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 AC154227.2-201ENSMUST00000228677 2101 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Gm21719-202ENSMUST00000189073 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Atr-201ENSMUST00000034980 8056 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Olfr156-204ENSMUST00000215406 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Mettl15-201ENSMUST00000081631 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Sec16b-201ENSMUST00000027881 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Tnfrsf10b-201ENSMUST00000022663 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Zfp521-201ENSMUST00000025288 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Gm43917-201ENSMUST00000191984 2360 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Phc3-203ENSMUST00000099163 2808 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Acvr1-202ENSMUST00000090935 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Setd5-202ENSMUST00000113155 6362 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Mx1-201ENSMUST00000023655 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Ica1l-206ENSMUST00000191251 3415 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Zmym5-201ENSMUST00000039812 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Spef2-205ENSMUST00000162780 1639 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Gm6313-202ENSMUST00000150112 2562 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Olfr744-202ENSMUST00000213668 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Oca2-201ENSMUST00000032633 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Fmo5-203ENSMUST00000107050 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Serping1-201ENSMUST00000023994 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Gm15079-201ENSMUST00000121943 216 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Fam229b-203ENSMUST00000125042 707 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Gm11695-201ENSMUST00000144230 407 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Gm6921-201ENSMUST00000161478 435 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Gm19705-201ENSMUST00000180495 496 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Slamf6-204ENSMUST00000194561 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 1700018P08Rik-201ENSMUST00000212522 1239 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 AC125350.5-201ENSMUST00000226102 517 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Lyzl1-201ENSMUST00000025076 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Sun3-201ENSMUST00000043377 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Olfr1449-201ENSMUST00000056005 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Olfr901-201ENSMUST00000063716 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Iba57-202ENSMUST00000069631 864 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Olfr328-201ENSMUST00000073933 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Klk1b3-201ENSMUST00000085450 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Gm7493-201ENSMUST00000085919 626 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Dmrtc1c2-202ENSMUST00000087899 717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Gm36993-201ENSMUST00000192983 2980 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Tnni3k-201ENSMUST00000064076 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Rassf6-201ENSMUST00000031317 1958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Gulp1-201ENSMUST00000074525 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 9930024M15Rik-201ENSMUST00000214902 2584 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Cobl-210ENSMUST00000174874 5451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Trpm3-201ENSMUST00000037901 5082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Gm12661-201ENSMUST00000118780 3335 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Gm31152-201ENSMUST00000210319 2171 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Tmem106b-201ENSMUST00000031556 6002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Map3k7-204ENSMUST00000108184 5491 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Slc2a9-203ENSMUST00000067886 3602 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Smok2b-202ENSMUST00000162940 2306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Tespa1-201ENSMUST00000042586 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 AC155298.3-201ENSMUST00000225307 3220 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Ctnnd1-203ENSMUST00000067232 6119 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 4921521D15Rik-201ENSMUST00000197578 1927 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Pik3ca-203ENSMUST00000108243 6689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Adam5-202ENSMUST00000118419 2791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Tg-201ENSMUST00000065916 8454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Mbnl2-201ENSMUST00000088419 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Gngt2-202ENSMUST00000100532 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Cntn3Q07409 Cep112-204ENSMUST00000106724 678 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms