Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Prkar2b-203ENSMUST00000146865 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Ints4-201ENSMUST00000026126 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Nod2-202ENSMUST00000109634 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Sulf1-203ENSMUST00000180062 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Cep95-201ENSMUST00000018516 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 4933427D14Rik-202ENSMUST00000108506 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Mcf2-202ENSMUST00000063507 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Fto-201ENSMUST00000069718 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Eif2ak4-205ENSMUST00000110872 4907 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Katnal1-201ENSMUST00000047257 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Ptprc-207ENSMUST00000183301 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Rgs4-202ENSMUST00000111357 2575 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Inpp5d-209ENSMUST00000168783 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 AC160637.1-201ENSMUST00000214037 3887 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Olfr1350-203ENSMUST00000219278 1768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm44937-201ENSMUST00000207705 2691 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Tm4sf1-202ENSMUST00000171384 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm37074-201ENSMUST00000193444 1843 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm43839-201ENSMUST00000196183 2325 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Slc6a3-201ENSMUST00000022100 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Myo18a-209ENSMUST00000108376 7374 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 C330007P06Rik-202ENSMUST00000115248 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Nup210l-202ENSMUST00000200410 5710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Hrh1-203ENSMUST00000160780 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Htr2c-201ENSMUST00000036303 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Ikbkap-201ENSMUST00000030140 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2bQ01097 Sptan1-208ENSMUST00000129241 7585 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Ift122-203ENSMUST00000112925 4122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms