Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Pik3ca-203ENSMUST00000108243 6689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Adgrl3-216ENSMUST00000121641 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Rab2b-202ENSMUST00000100631 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Ephx2-202ENSMUST00000224698 1985 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Hivep2-201ENSMUST00000015645 9763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Adgrb3-207ENSMUST00000151309 5448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Dhx8-201ENSMUST00000039152 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Olfr443-ps1-202ENSMUST00000204422 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Arhgef9-207ENSMUST00000113885 4578 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Slc5a6-206ENSMUST00000202556 3078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Casr-201ENSMUST00000063597 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Celf5-204ENSMUST00000120856 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Bdp1-204ENSMUST00000109379 7567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Slc8a1-202ENSMUST00000163123 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Piwil4-203ENSMUST00000115644 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm45861-201ENSMUST00000209669 7184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Ceacam20-201ENSMUST00000094753 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Zkscan5-201ENSMUST00000031601 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Sulf1-205ENSMUST00000186051 4563 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Prdm15-203ENSMUST00000121584 6194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Rnmt-201ENSMUST00000009679 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm973-201ENSMUST00000114243 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm28370-201ENSMUST00000185303 3375 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Olfr429-202ENSMUST00000216346 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Nrip1-202ENSMUST00000121927 7868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 C5ar2-201ENSMUST00000098792 3429 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nphp4P59240 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms