Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Kpna3-201ENSMUST00000022496 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Mbtps1-202ENSMUST00000098362 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprkP35822 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Trub1-202ENSMUST00000026073 3795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Ptprc-207ENSMUST00000183301 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm37159-201ENSMUST00000192720 3605 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Ucp2-202ENSMUST00000126534 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Pkp4-203ENSMUST00000112577 4222 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Sorbs1-212ENSMUST00000225148 2379 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 E330035G20Rik-201ENSMUST00000221094 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 AC152922.1-201ENSMUST00000216518 1232 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Rgs4-202ENSMUST00000111357 2575 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 AC123842.1-201ENSMUST00000217622 3118 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm10302-201ENSMUST00000174433 3535 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Aph1b-201ENSMUST00000034934 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Phc2-203ENSMUST00000106080 3885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Map4k4-209ENSMUST00000192509 3918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Supt7l-204ENSMUST00000201769 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Ttc30a1-201ENSMUST00000099994 3721 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Tpd52l2-204ENSMUST00000108800 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Adgrd1-203ENSMUST00000156437 4141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Fto-201ENSMUST00000069718 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Fbxw10-201ENSMUST00000036085 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 A630001O12Rik-201ENSMUST00000212914 2182 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 4930542C16Rik-201ENSMUST00000062438 1090 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Katnal1-201ENSMUST00000047257 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Eif2ak4-205ENSMUST00000110872 4907 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Lhfpl2-202ENSMUST00000118195 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm44531-201ENSMUST00000208364 2000 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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