Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrkcdP28867 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrkcdP28867 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrkcdP28867 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrkcdP28867 Gm31182-201ENSMUST00000219061 2391 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrkcdP28867 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrkcdP28867 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrkcdP28867 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrkcdP28867 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrkcdP28867 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrkcdP28867 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PrkcdP28867 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PrkcdP28867 9530052C20Rik-201ENSMUST00000181882 1372 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PrkcdP28867 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PrkcdP28867 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PrkcdP28867 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PrkcdP28867 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PrkcdP28867 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PrkcdP28867 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PrkcdP28867 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PrkcdP28867 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PrkcdP28867 Musk-205ENSMUST00000102893 3323 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PrkcdP28867 1700095J07Rik-201ENSMUST00000128017 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PrkcdP28867 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
PrkcdP28867 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PrkcdP28867 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PrkcdP28867 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm13573-201ENSMUST00000116410 631 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm16618-201ENSMUST00000134992 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm24347-201ENSMUST00000158711 142 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm42556-201ENSMUST00000201397 607 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm32710-201ENSMUST00000210677 618 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 AC130829.2-201ENSMUST00000222931 127 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Klf6-201ENSMUST00000000080 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Ssr3-201ENSMUST00000029414 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm14226-201ENSMUST00000130870 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm44550-201ENSMUST00000207311 2058 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 St7-206ENSMUST00000115417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Hist1h4f-201ENSMUST00000102971 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Hist1h4h-201ENSMUST00000102972 470 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm6292-201ENSMUST00000120712 1095 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm15324-201ENSMUST00000139397 355 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm24039-201ENSMUST00000157878 132 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Obox2-203ENSMUST00000174076 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Tmem147os-201ENSMUST00000180820 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm6799-201ENSMUST00000186919 573 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm31243-201ENSMUST00000197498 632 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PrkcdP28867 Gm3198-201ENSMUST00000208725 1026 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms