Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ghrh-202ENSMUST00000109536 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm11907-201ENSMUST00000118918 1007 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm24994-201ENSMUST00000157414 121 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Ighv1-62-2-201ENSMUST00000163467 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm17122-201ENSMUST00000166047 372 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Ighv1-71-201ENSMUST00000166645 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm8167-201ENSMUST00000183320 958 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm42489-201ENSMUST00000198964 669 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm44285-201ENSMUST00000203557 940 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Olfr737-ps1-201ENSMUST00000205382 283 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Mrpl22-201ENSMUST00000020820 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm4977-201ENSMUST00000215709 1262 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Asb12-201ENSMUST00000033549 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Olfr466-201ENSMUST00000058907 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Glipr1-201ENSMUST00000074805 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 AC166159.1-201ENSMUST00000227154 1380 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Adgrb3-201ENSMUST00000041838 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RxraP28700 Cpne4-203ENSMUST00000098443 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm33035-201ENSMUST00000219854 1718 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm38195-201ENSMUST00000194247 1499 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Rgs8-204ENSMUST00000111814 678 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm14032-201ENSMUST00000117686 1026 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Snrp1c-ps2-201ENSMUST00000120976 365 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Pogk-201ENSMUST00000127596 769 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Crem-218ENSMUST00000139537 807 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Fbxl12-210ENSMUST00000155301 476 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm17970-201ENSMUST00000192199 685 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 4933432K03Rik-201ENSMUST00000205739 1247 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 4930483O08Rik-201ENSMUST00000209850 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm18629-201ENSMUST00000222496 884 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm24143-201ENSMUST00000082633 145 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Dmrtc1c2-202ENSMUST00000087899 717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Ifna4-201ENSMUST00000094973 561 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Olfr225-202ENSMUST00000213169 2658 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Lpp-201ENSMUST00000038053 15647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm17083-201ENSMUST00000165849 1366 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 CT009718.2-201ENSMUST00000221408 1428 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RxraP28700 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Ankfn1-203ENSMUST00000169201 2232 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Atxn7l1-201ENSMUST00000077456 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Crbn-202ENSMUST00000113239 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Tmem91-202ENSMUST00000108404 485 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm26469-201ENSMUST00000116765 121 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm7785-201ENSMUST00000117121 892 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Armt1-202ENSMUST00000117489 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm25266-201ENSMUST00000158521 304 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm7031-201ENSMUST00000173709 919 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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